Developer docs

文档Build with OmicOS

这里是 OmicOS 的系统文档入口。当前版本先公开系统概念、数据路线和 Agent 工作流;API、部署和权限文档将在内测阶段开放。

01 · Start

数据接入

支持 h5ad、mtx、csv、空间转录组和公开 atlas。系统先识别物种、组织、批次和质量风险,再决定下游流程。

02 · Agent

任务编排

Leader Agent 拆解任务,QC、Annotation、Integration、Trajectory、Report 等 specialist agents 负责专业步骤。

03 · Tools

工具调度

OmicOS 调用 OmicVerse 与生态工具,记录版本、参数、失败路径和替代方案,避免不可追踪的黑箱结果。

04 · Delivery

证据交付

每次运行输出 notebook、图表、解释、证据链和限制条件,研究者可以接管代码,团队可以复用流程。

从原始矩阵到决策证据。

文档会围绕同一条执行路线组织,而不是围绕零散函数列表组织。

01
Data intake读取单细胞、空间、bulk、多组学和公开 atlas。
02
Context parse识别物种、组织、实验设计、批次和质量风险。
03
Agent plan拆解任务,选择工具,生成可执行分析方案。
04
Tool run调度 OmicVerse 与生态工具,执行并记录参数。
05
Validation检查结果稳定性、marker 合理性和统计证据。
06
Delivery输出 notebook、图表、解释和可追溯报告。